鳜传染性脾肾坏死病毒p31基因结构及序列分析
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中山大学生命科学学院

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广东省自然科学基金


Characterization of the p31 gene of infectious spleen and kidney necrosis virus of Siniperca chuatsi
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School of Life Science,Zhongshan University,Guangzhou 510275, China

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    摘要:

    报道了鳜传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)的p31基因结构及其序列分析.对ISKNVDNAHindmE酶切片段的序列分析结果发现该序列中含有完整的p31基因.ISKNVp31基因完整读码框为675bp,GC含量为49.78%,等电点为7.61,编码一个长为225aa、分子量为25.3 kD的推定蛋白.结构分析发现该基因具有启动子元件TATA box和CAAT motif,下游有反向重复序列可形成茎环,另外还有一段直接重复序列和二联体结构.ISKNV与其它3种虹彩病毒(包括FV3、LCDV-1和EHNV)的p31基因氨基酸序列具有一定的同源性,但ISKNV与它们的同源性不高,序列比较和系统树分析发现ISKNV与蛙病毒属和淋巴囊肿病毒属的病毒都不尽相同.

    Abstract:

    P31 gene of infect ious spleen and kidney necrosis virus ( ISKNV ) of Siniperca chuatsi had been sequenced. The open reading frame of the gene is 675 nucleotides long, encoding a putative protein of 225 amino acids with 25. 3kD. The 5. noncoding region has a TATA box and CAAT motif. A stem loop, a direct repeat sequence and a short dyad are contained downstream of the translation stop codon. The results of comparison of the homology with other iridoviruses p31 genes showed that ISKNV p31 gene has lower identities with others. Alignment of amino acid sequences and a phylogenetic tree of p31 genes of four iridoviruses have been constructed. The results indicated that ISKNV is different from the viruses of the genus Ranavirus and Lymphocystivirus.

    参考文献
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引用本文

邓敏.鳜传染性脾肾坏死病毒p31基因结构及序列分析[J].水产学报,2001,25(6):

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  • 收稿日期:2014-04-14
  • 最后修改日期:2014-04-14
  • 录用日期:2014-04-14
  • 在线发布日期: 2014-04-14
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