摘要:

摘要:由Ostrom提出的社会—生态系统（social-ecological system， SES）分析框架是当前国际上用于分析公共池塘资源管理问题的一个前沿理论工具。本文综览当前SES分析框架在国外渔业管理领域的大量研究文献，在归纳、整理研究尺度和对象的基础上，从系统变量识别、变量相互作用分析、系统结果识别、适应性管理设计和适应性管理执行与监督5个层面对SES分析框架在国外渔业管理领域的应用研究进行了系统梳理和评述。虽然当前SES分析框架在渔业管理领域的应用研究在变量识别、数理实证和研究尺度拓展等方面尚有待进一步完善和发展，但现有国外研究成果对于新形势下我国渔业管理理论研究和渔业管理制度改革均具有十分重要的参考价值。

摘要:C型凝集素是一种依赖于Ca²⁺而发挥功能的糖蛋白，在一线的固有免疫防御过程中发挥着重要作用。围绕对虾C型凝集素开展深入研究，不仅可以丰富无脊椎动物固有免疫学内容，还有望将其开发为具有免疫增强效果的活性饵料，应用于对虾的健康养殖。本实验根据实验室前期转录组信息提示克隆获得了凡纳滨对虾一种新的C型凝集素基因（LvLc1， GenBank注册号：KY937940）。生物信息学分析显示LvLc1基因的开放阅读框全长891 bp，编码296个氨基酸，该基因编码的蛋白质含有一个保守的糖识别结构域（carbohydrate recognition domain， CRD），该结构域中具有潜在的半乳糖结合位点（QPD motif），进化发生分析显示LvLc1与来自节肢动物的甘露糖结合凝集素家族成员聚类在一起。对LvLc1基因的CRD结构域进行了原核重组表达与蛋白活性分析研究，结果显示：重组目的蛋白（rLvLc1）在Ca²⁺存在的条件下，对多种病原菌（G⁺、G^-和真菌）具有凝集作用，其凝集活性可被半乳糖、甘露糖、脂多糖等多种病原相关分子模式所抑制。研究表明，LvLc1作为C-型凝集素家族一个新成员，可能通过重要的模式识别受体作用，参与机体应答病原微生物侵染的防御过程。

摘要:为探究不同营养类型养殖方式对半封闭海湾浮游生态系统的影响，于2015年在象山港的鱼类网箱养殖、牡蛎筏式养殖和海带筏式养殖3种养殖区内外分别进行大、中型和中、小型浮游动物群落及相关环境因子的四季研究。结果显示，牡蛎养殖区内大、中型浮游动物群落结构变化明显，夏、秋季优势种太平洋纺锤水蚤的优势度下降，冬季优势种腹针胸刺水蚤的优势度上升；网箱养殖区内浮游动物群落变化不明显，变化主要为大、中型浮游动物优势种，春、冬季腹针胸刺水蚤的优势度下降，秋季优势种种类组成变化明显；海带养殖区内浮游动物群落和优势种变化均不明显。此外，3种养殖方式对浮游动物的生物量、丰度和α多样性均未产生明显影响。结合象山港的水文特征和养殖区内外的环境因子，研究表明，牡蛎养殖区浮游动物群落变化是牡蛎滤食行为和铁港水交换能力差的综合结果，而浮游动物优势种变化可能与水体总磷含量较高有关；因目前网箱养殖规模小且西沪港水动力条件较好，网箱区内局部环境和浮游动物的变化较小；海带养殖因面积小且仅春、冬季养殖，不足以对水质和浮游动物产生影响。此外，本研究显示不同环境中，大、中型浮游动物群落结构的变异较中、小型浮游动物明显，这可能与中、小型浮游动物群落的稳定性较高有关。

摘要:黄海南部海域具有复杂的水团结构和海流环境，使该海域鱼类群落产生较为复杂的空间结构。为研究黄海南部近岸海域鱼类群落结构特征，实验根据2014—2015年对该海域进行4个季度的底拖网调查数据，利用多元统计方法分析了该海域鱼类群落的分布格局并比较了各群落的相对生物量、生物多样性、优势种等结构特征。应用聚类分析（cluster）和多维标度排序（MDS）分析将黄海南部近岸海域划分为海州湾群落与江苏近岸群落；海州湾群落的平均相对资源量和生物多样性均高于江苏近岸群落，而暖温性与暖水性鱼类所占比重相对较低；海州湾群落的优势种主要为方氏云鳚、大泷六线鱼和日本鳀等，季节变化显著；江苏近岸群落的优势种为短吻红舌鳎、途；、棘头梅童鱼和黑鳃梅童鱼等，季节变化不明显。研究表明，黄海南部近岸海域可划分为海州湾区系与江苏近岸区系，其鱼类群落结构特征具有显著差异。海流、水团、底质类型及水深等环境因子是形成鱼类群落结构差异的主要因素。

摘要:赤潮往往给渔业生产和人类的生命安全造成极大的危害，但由于赤潮的成因十分复杂，对其进行预报非常困难。本研究收集了福建海区2000年至2016年发生的219个赤潮案例有效数据，应用BP神经网络人工智能模型建立了其与气温、降水、风速、气压和日照5个气象因子的非线性关系，并将这些赤潮案例数据与相应的气象指标按闽东、闽中和闽南3个海区，分别输入模型进行学习、训练与预测。结果显示：1）闽东海区53个训练样本45个预测正确，正确率达84.91%，3个模拟预测样本全部正确；2）闽中海区69个训练样本58个预测正确，正确率达84.06%，4个模拟预测样本全部正确；3）闽南海区85个训练样本的运算预测结果63个正确，正确率74.12%，5个模拟预测样本全部正确，达到预期的结果。研究表明，以气象因子为自变量采用BP神经网络模型对赤潮的发生进行预测是可行的，该方法可为赤潮的预测提供新的途径。

摘要:为深入研究鱼类干细胞多能性转录因子Nanog的功能，本实验进行了团头鲂Nanog基因的原核表达和多克隆抗体的制备。首先，从团头鲂卵巢克隆出Nanog基因的编码区，将其连接到pET32a载体上构建原核表达载体。接着将重组载体转化至大肠杆菌BL21（DE3）pLysS，通过异丙基-β-D-硫代半乳糖苷（IPTG）诱导表达，获得预期大小的Nanog重组蛋白，并获得大量蛋白以制备抗体。最后通过ELISA检测抗体的效价和采用Western blot技术检测Nanog抗体的特异性。结果显示，在37 ℃，0.5 mmol/L IPTG诱导4 h可获得Nanog重组蛋白的高效表达；制备的多克隆抗体能够有效识别原核表达的Nanog蛋白及团头鲂肝脏和精巢的内源Nanog蛋白；该抗体也可应用于检测HepG2细胞中过表达的团头鲂Nanog蛋白。本研究为蛋白的原核表达和特异性抗体的制备及验证提供了研究思路，也为研究鱼类Nanog基因功能提供了特异性抗体。

摘要:为研究饲料中添加不同浓度的粪肠球菌对吉富罗非鱼生长、体组成、消化能力及血液生理生化指标的影响，实验选用初始体质量为（50.59±0.59） g的吉富罗非鱼300尾，随机分成5组，每组设3个重复，每个重复20尾鱼，养殖实验期60 d。分别投喂实测含1.3×10²（对照组）、1.4×10⁵、1.7×10⁶、1.5×10⁷和1.8×10⁸ CFU/g粪肠球菌的5种等氮（36 %）等脂（6.75%）的实验饲料。结果显示：①罗非鱼的末均重（FBW）、增重率（WGR）、特定生长率（SGR）和尾均摄食量（FI）均在1.5×10⁷ CFU/g组达到最大且显著高于对照组，而饲料系数（FCR）显著低于对照组。以FBW、WGR和SGR为评价指标，通过二次回归分析得出，罗非鱼饲料的粪肠球菌适宜添加浓度范围为7.5×10⁷~1.1×10⁸ CFU/g。②各添加组的全鱼粗蛋白含量均显著高于对照组，1.5×10⁷ CFU/g组的粗脂肪含量显著高于对照组，各组间全鱼水分和粗灰分含量无显著差异。1.5×10⁷ CFU/g组的干物质、蛋白质和脂肪沉积率均达到最大值且显著高于对照组。③1.5×10⁷和1.8×10⁸ CFU/g组的肠脂肪酶活性均显著高于对照组，而1.8×10⁸ CFU/g组的肠道蛋白酶活性显著低于对照组；各组间肠道淀粉酶活性无显著差异。④1.5×10⁷ CFU/g组的平均红细胞体积、血红蛋白浓度和血小板数均显著低于对照组，各组间红细胞数无显著差异。⑤1.8×10⁸ CFU/g组的血清中胆固醇、葡萄糖和丙二醛含量显著低于对照组；1.5×10⁷ CFU/g组血清中碱性磷酸酶活性显著高于对照组，而谷丙转氨酶和谷草转氨酶活性显著低于对照组。综上所述，吉富罗非鱼（50~210 g）饲料中粪肠球菌的适宜添加浓度范围为7.5×10⁷~1.1×10⁸ CFU/g，但添加粪肠球菌对血液载氧能力有负面影响。

摘要:转座子在生物基因组中占据重要的组成部分，是基因组中可移动和扩展的重要元件，其转座活性受外界环境因子调控。为了探讨环境应激对基因组转座子表达活性的影响，用环境污染物二噁英（TCDD）和重金属Cu²⁺或Cd²⁺处理斑马鱼早期胚胎，通过荧光定量PCR （qRT-PCR）比较处理前后9种结构完整的转座子转录活性变化，这9种转座子分别是DNA转座子Tc1家族的Tc-a、Tc-b、Tc-c、Tc-d、Tc-e，反转录转座子病毒家族ZB-ERV-1、ZB-ERV-2、反转录转座子LINE家族L1-323和L1-21。结果发现，TCDD使8个转座子转录活性明显下调，1个转座子显著上调；Cu²⁺导致7个转座子上调，2个显著下调；Cd²⁺导致6个转座子上调，3个显著下调。研究表明，斑马鱼转座子转录活性受环境因素影响显著，环境胁迫可能是转座子活性变化的原因之一。本研究对了解和评估环境因子对鱼类转座子活性的影响作用具有重要的意义，为进一步研究生物基因组的进化机制提供参考。

摘要:研究复方中草药（葛根、黄连、金银花、板蓝根、黄芪、甘草、柴胡、当归、山楂、陈皮和茯苓）对凡纳滨对虾生长、消化酶和免疫因子活性及抗WSSV的影响，为对虾健康养殖提供科学依据。分别在饲料中添加0%（对照组）、0.4%、0.8%、1.2%、1.6%和2.0%该复方中草药，连续投喂凡纳滨对虾[体质量（0.026±0.007） g] 28 d（每组3个重复，每个重复160尾），每隔1周随机采样10尾/桶测量体长、体质量，并取肝胰腺用于生长指标（WGR、SGR、FR和SR）、相关酶（淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶、SOD、GPT和GOT）及MDA含量的测定。研究结果表明，复方中草药对凡纳滨对虾的生长均有提高，其中0.8%和1.2%添加组效果最佳，差异显著；且饵料系数显著下降。对虾肝胰腺消化酶（淀粉酶、蛋白酶、脂肪酶）和免疫相关因子（SOD、GPT和GOT）随养殖时间的延长，高酶活性逐渐由高添加量组向低添加量组移动，其中以0.8%和1.2%添加组效果最佳，差异显著；与对照组相比，0.4%，0.8%和1.2%添加组MDA含量差异显著下降。对照组和0.4%添加组对虾经投喂感染WSSV后全部死亡，但0.4%添加组对虾第1尾死亡时间、50%死亡时间以及100%死亡时间分别比对照组延后8 h、16 h和8 h；0.8%添加组成活率最高（33.3%），与其他组差异显著。复方中草药能促进对虾生长、消化，提高免疫和抗WSSV能力，其中以添加0.8%和1.2%效果最佳。

摘要:性早熟是中华绒螯蟹养殖过程中普遍存在的一个问题。为发掘中华绒螯蟹性早熟相关的重要功能基因，实验采用Illumina Hiseq 2000高通量测序技术获得了正常与性早熟雌蟹的Y-器官转录组数据，并进行比较分析。结果显示，测序分别获得44 619 538和43 052 958个clean reads，比对发现2655个差异表达基因，Gene Ontology （GO）功能分类分析将文库中的差异表达基因归类到3大功能（生物过程、细胞组分和分子功能）的42个类别中。KEGG富集分析将文库中的差异表达基因富集到134条特定的KEGG代谢途径，其中4条是显著性富集，包括酮体合成和降解、丁酸甲酯代谢、神经营养因子信号通路和碱基切除修复通路。通过RNA-seq技术获得了丰富的中华绒螯蟹Y-器官转录组信息，为中华绒螯蟹新基因克隆、性早熟成因与预防和Y-器官的研究提供有价值的数据。

摘要:黏附因子在病原菌的致病过程中发挥了重要作用，鉴定新的黏附因子是了解病原菌致病机制的重要手段。本研究中首次发现游离肝素能够竞争性抑制副溶血弧菌与Hela细胞的黏附，表明细胞外基质中的肝素可能是细菌重要的细胞表面黏附受体。进一步利用肝素亲和层析技术垂钓到6种副溶血弧菌的外膜蛋白，并通过基因克隆和原核表达技术成功获得重组的外膜蛋白并对其进行了深入研究。重组蛋白IMPDH、EF-Tu和OppA可黏附Hela细胞，并可以显著抑制副溶血弧菌与Hela细胞的黏附，说明这3种蛋白可能是其重要的潜在黏附因子。

摘要:为了查清乳山（RS）和崆峒岛（KTD）海域长牡蛎生长性状各指标的遗传力、遗传相关和表型相关，本实验通过部分因子交配设计和人工授精的方法建立家系，并在乳山和崆峒岛海域进行养殖。用混合线性模型分别计算RS和KTD海域188日龄、338日龄和474日龄长牡蛎生长性状各指标的遗传参数。结果发现：不同日龄长牡蛎生长性状各指标，在乳山海域的遗传力是0.28~0.55，为中高遗传力，在崆峒岛海域的遗传力是0.34~0.63，为高遗传力；与乳山海域相比，崆峒岛海域各指标的遗传力偏高。运用亲本模型，将日龄和地点作为固定效应，计算得到壳高、壳长、壳宽和湿重的遗传力分别为0.25±0.08、0.29±0.09、0.14±0.05和0.26±0.09。不同海域、不同日龄的遗传相关和表型相关结果各不相同，但各指标间均呈现正相关；总体来讲，性状间的遗传相关大于表型相关。实验结果有助于掌握山东半岛南北两侧长牡蛎生长性状的数量遗传学参数，为制定长牡蛎在该海域的选育技术路线提供数据支持。

摘要:为了探究TLR6 （Toll like receptor 6）在马氏珠母贝免疫反应中的作用，实验采用cDNA末端快速扩增（RACE）技术获得了马氏珠母贝TLR6基因（Pm-TLR6）cDNA全长序列，并且运用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术检测了Pm-TLR6在马氏珠母贝各组织中的表达情况、哈维氏弧菌刺激后和植核移植后血淋巴中的表达模式。结果显示：Pm-TLR6 cDNA全长2295 bp，其中5'非编码区（UTR）长94 bp，3'UTR长89 bp，开放阅读框（ORF）长2112 bp，编码703个氨基酸；多序列比对结果表明物种间TLR6具有较高的保守性；Pm-TLR6具有跨膜域、富含亮氨酸的重复序列（LRRs）和TIR域，符合TLRs家族特征。qRT-PCR数据分析表明，Pm-TLR6在马氏珠母贝肝胰脏、血细胞、鳃、性腺、闭壳肌、外套膜中均有表达，其中肝胰脏中表达量最高；哈维氏弧菌刺激后，Pm-TLR6在2 h表达上调，约为对照组（0 h）的9倍，随后的6 h恢复至正常水平，直至16 h表达水平开始回升并于24 h达到最大表达量，是对照组的29.4倍，具有显著性差异；植核移植实验结果显示Pm-TLR6在植核后5和10 d表达水平没有显著性变化，15和20 d表达量出现上升趋势，但差异不显著，最后于30 d达到最大值，约为空白对照组（0 d）的5倍，具有显著性差异。研究表明，Pm-TLR6可能在马氏珠母贝免疫防御反应中担任着重要的角色。

摘要:为了解中国水生动物源无乳链球菌的分子流行特征，揭示其传播和流行规律，本实验对分离得到并鉴定的10株7种水生动物源无乳链球菌通过分子血清型、多位点序列分型（MLST）分型、毒力基因型和前噬菌体分型等方法进行分子分型；其次，通过斑马鱼评价7种水生动物源无乳链球菌的致病性。分子血清型分析结果表明，10株无乳链球菌可分为3种血清型，即Ⅰa、Ⅰb和Ⅲ型；MLST分型结果表明，Ⅰa型无乳链球菌均为ST7型，Ⅰb无乳链球菌均是ST261型，只有Ⅲ型无乳链球菌是ST739型。进一步分型结果表明，10株无乳链球菌可分为3种毒力基因型和4种前噬菌体基因型。根据4种分型结果可知，10株水生动物源无乳链球菌可分为4种类型，其中虎纹蛙源无乳链球菌具有独立的分子血清型、MLST型、毒力基因型和前噬菌体基因型，即Ⅲ-ST739-V1-P3；罗非鱼源无乳链球菌的基因型有3种，即Ⅰa-ST7-V2-P1、Ⅰa-ST7-V2-P2和Ⅰa-ST7-V3-P4；红尾皇冠鱼、鳙和罗非鱼源无乳链球菌的基因型相同：Ⅰa-ST7-V2-P2；卵形鲳鲹、宝石鲈和罗非鱼源无乳链球菌具有相同的基因型：Ⅰa-ST7-V2-P1；鲮和罗非鱼源无乳链球菌的基因型相同，即Ⅰb-ST261-V3-P4。致病性研究表明，7种水生动物源无乳链球菌对斑马鱼均有强致病性。研究表明，两栖类虎纹蛙源无乳链球菌和鱼源无乳链球菌的基因型明显不同，它们之间遗传变异较大，因此，无乳链球菌在两栖类和鱼类之间相互传播的可能性较小。鱼源无乳链球菌有3种基因型，且这3种基因型均在罗非鱼中流行，这表明无乳链球菌在鱼类中相互传播的可能性较大，尤其是在罗非鱼与其他鱼类之间。

摘要:为探讨虾夷扇贝闭壳肌中横纹肌（ST）和平滑肌（SM）蛋白分布特征及理化性质差异。对肌肉组织进行切片、苏木精—伊红染色后，在光学显微镜下观察肌肉组织形态，SDS-PAGE分析蛋白组成，通过盐溶性和Ca²⁺-ATPase对理化性质进行了比较研究。研究表明，横纹闭壳肌的肌纤维更粗，肌细胞间更致密；Myorod蛋白仅存在于平滑闭壳肌中，在横纹闭壳肌中不存在；副肌球蛋白在平滑闭壳肌中含量为31%，横纹肌中仅为11%。2种肌肉盐溶曲线也完全不同，在0.05~1.0 mol/L盐浓度范围内平滑肌的溶解性呈S型曲线上升，而横纹肌呈直线型上升，这种差异可能与副肌球蛋白含量有关。此外，平滑肌和横纹肌肌原纤维蛋白Ca²⁺-ATPase最适温度分别为35和30 ℃，活化能分别为23.4和11.3 kJ/moL。

摘要:为了探讨罗非鱼杂种优势形成过程中基因组DNA甲基化模式的变化，运用甲基化敏感扩增多态技术（methylation sensitive amplified polymorphism， MSAP）分析橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼及其杂交种莫荷罗非鱼“广福1号”的皮肤、肌肉和鳃等11种组织的DNA甲基化水平差异。采用16对引物进行选择性扩增，经聚丙烯酰胺凝胶电泳带型分析结果显示：莫荷罗非鱼“广福1号”及其亲本在不同组织间的甲基化水平存在组织特异性，相同组织不同亲、子代罗非鱼间的甲基化程度亦不同；橙色莫桑比克罗非鱼、荷那龙罗非鱼以及“广福1号”各组织平均总甲基化水平分别为32.21%、38.03%和29.77%，莫荷罗非鱼“广福1号”的甲基化水平低于双亲；与亲本相比，莫荷罗非鱼“广福1号”的甲基化模式除了大多数保持稳定遗传（A、B、C类型分别为19.67%、29.99%、25.42%）之外，24.92%胞嘧啶位点发生去甲基化和超甲基化，且去甲基化位点（E类型，15.73%）多于超甲基化位点（D类型，9.19%）。研究表明，莫荷罗非鱼“广福1号”基因组DNA的低甲基化特征和甲基化模式的重调可能与耐盐杂种优势有关。