水产学报  2019, Vol. 43 Issue (4): 742-750    DOI: 10.11964/jfc.20171011012.   PDF    
黄颡鱼Wnt/β-catenin信号通路5个重要基因的识别及其在卵巢中的表达对铜暴露的响应
张丽晗 , 罗智 , 有文静 , 李丹丹 , 徐异桓 , 潘亚雄     
华中农业大学水产学院,动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,湖北 武汉    430070
摘要:采用RT-PCR和RACE技术获取了黄颡鱼Wnt/β-catenin信号通路5个重要基因wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1的全长cDNA序列,分别为1 743、2 133、1 379、1 508和2 636 bp,其中ORF长度分别为1 052、1 115、872、1 160和2 372 bp,分别编码351、372、291、387和791个氨基酸。氨基酸序列比对和系统发育树分析显示,上述基因十分保守,黄颡鱼与墨西哥丽脂鲤亲缘关系最近。组织表达分析显示,上述基因的mRNA在脑、脾脏、肾脏、鳃、心脏、肌肉、肠系膜脂肪、肝脏及卵巢等组织中都有表达,但表达水平不尽相同。这些基因在黄颡鱼卵巢中的表达水平对铜暴露的响应结果显示,在暴露28 d时,wnt3a mRNA水平随着铜浓度的增加而降低,而wnt8a趋势则相反,wnt2、wnt2bbctnnb1基因表达各个处理组间无显著性差异;在56 d时,wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因表达各个处理组间均无显著差异。研究表明,Wnt/β-catenin信号通路基因的功能发生了分化,部分成员可能介导了铜影响黄颡鱼卵巢发育的调控。
关键词黄颡鱼    Wnt/β-catenin    基因克隆    组织    铜暴露    

Wnt信号转导通路是机体重要的转导通路之一,在调节细胞增殖、分化、胚胎发育和卵泡生成方面具有重要作用[1-2],它分为经典的Wnt信号通路和非经典的Wnt信号通路,其中经典Wnt信号通路即Wnt/β-catenin通路,主要由WNT1、WNT2、WNT3A和WNT8参与[3],是Wnt信号中研究最清楚的一条通路,在整个进化过程中高度保守。目前在哺乳动物中已经克隆鉴定了19种WNT蛋白[4],并且表明Wnt在卵巢发育的各个时期广泛表达[5];Wnt信号通路的错误调节可导致包括卵巢发育失调在内的多种病理变化[6-7]。在鱼类研究中同样克隆得到了Wnt/β-catenin信号通路一些基因的cDNA序列,如斑马鱼(Danio rerio)[8-10]等。最近,本课题组克隆得到了黄颡鱼(Pelteobagrus fulvidraco)Wnt家族4个基因(wnt5awnt5bwnt7awnt9b)的全长cDNA序列[11]。关于它们的功能,部分研究涉及到Wnt/β-catenin信号通路在鱼类发育过程中的生理作用[9],也有研究表明Wnt通路在哺乳动物卵巢发育和激素分泌过程中起着重要作用[12-13]。然而,到目前为止,Wnt/β-catenin信号通路在鱼类发育和激素分泌中所起的作用尚不清楚。

铜是包括鱼类在内的脊椎动物必需的微量元素之一,广泛地参与体内的许多生化过程,然而,过量的铜对生物体可产生毒性作用[14]。Zhang等[15]研究发现,水体铜暴露能影响黄颡鱼的卵巢发育和激素分泌[15],进一步的研究表明铜差异性影响了黄颡鱼Wnt家族4个基因(wnt5awnt5bwnt7awnt9b)的mRNA表达水平[11]wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1同是Wnt/β-catenin信号通路的重要成员,研究者设想上述基因和蛋白介导了铜影响黄颡鱼卵巢发育的调控。所以,作为全面解析黄颡鱼Wnt/β-catenin信号通路功能的一部分,本研究克隆得到了黄颡鱼Wnt/β-catenin信号通路5个重要基因(wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1)的全长cDNA序列,探讨了它们的组织表达模式,进一步研究了水体铜暴露对上述基因mRNA表达的影响,为深入研究Wnt/β-catenin信号通路在鱼类卵巢发育和激素分泌中所起的作用奠定基础。

1 材料与方法 1.1 实验对象

本实验中雌性黄颡鱼分为2组,均购自武汉上涉湖养殖场。第1组用于Wnt/β-catenin通路基因cDNA序列的克隆和组织表达水平的测定。用于基因克隆的黄颡鱼组织样品为肝脏和卵巢组织。用于基因表达谱测定的组织包括脑、脾脏、肾脏、鳃、心脏、肌肉、肠系膜脂肪、肝脏和卵巢。取样参考文献[16-17]。

第2组用于探讨水体铜暴露对黄颡鱼卵巢Wnt/β-catenin家族基因表达水平的影响。实验参照已有方法[15],并在相应的平行研究中做了详细的叙述[11]。216尾规格均一的黄颡鱼[平均体质量(10.2±0.2) g,mean±SE]随机放入9个300 L玻璃纤维缸中,每缸24尾,分别暴露在铜浓度为0(对照组)、30(低浓度组)和60(高浓度组) μg/L的水体中,每个处理设3个重复(即3个缸)。水中铜浓度的实测值分别为(3±1) μg/L、(31±2) μg/L和(62±3) μg/L (mean±SE,n=16)。实验期间,黄颡鱼每天饱食投喂商业饲料2次。实验持续8周,分别在第28天和56天进行取样,用于基因表达水平的测定。

1.2 实验药品

RNA提取试剂盒(Trizol Reagent)、逆转录试剂盒、3′-Full RACE Kit试剂盒、5′-Full RACE Kit试剂盒、荧光定量试剂盒、凝胶纯化回收试剂盒、Taq酶、DNA Marker (2000)、dNTP等试剂购自大连宝生物公司(TaKaRa);胰蛋白胨和酵母粉购自Sigma公司;无水乙醇、氯仿、异丙醇等为中国国药分析纯产品。

1.3 Wnt/β-catenin信号通路5个基因cDNA序列的克隆

参考文献[16-17],总RNA的提取参照Invitrogen的TRIzol说明书进行。总RNA的质量通过琼脂糖凝胶电泳进行检测,其浓度及OD260/OD280值通过Nanodrop ND-2000分光光度计测定。然后,以提取的总RNA为模板,用TaKaRa的反转录试剂盒(PrimeScriptTMII 1st Strand cDNA Synthesis Kit)合成第一链cDNA。

根据GenBank及Ensembl数据库中已报道的鱼类wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因序列,设计简并引物(表1),以扩增其基因cDNA核心片段。PCR反应程序:94 °C预变性4 min;94 °C变性30 s,55 °C退火 30 s,72 °C延伸1 min,30个循环;72 °C终延伸5 min。然后分别设计3′和5′ RACE特异性引物(表1)进行巢式PCR反应。Outer-PCR反应参数:94 °C预变性3 min;然后94 °C 30 s,55 °C 30 s,72 °C l min,共25个循环;最后72 °C再延伸10 min。Inner-PCR反应参数:94 °C预变性3 min;94 °C变性30 s,55 °C退火30 s,72 °C延伸1 min,共30个循环;最后72 °C终延伸10 min。

表 1 黄颡鱼wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1 cDNA序列信息 Tab.1 The information for wnt2, wnt2bb, wnt3a, wnt8a and ctnnb1 cDNAs cloned from P. fulvidraco
1.4 序列分析

用DNAStar软件将扩增得到的核心片段、3′和5′末端序列拼接,从而获得基因cDNA全长。获得的核苷酸序列经NCBI进行BLAST,以确定该序列对应的基因亚型(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)。同时,运用DNAStar软件找出开放阅读框(ORF)并翻译成氨基酸序列。序列比对和氨基酸同源性分析使用Clustal-W软件。进化树用MEGA 5.0软件采用邻接法(NJ)构建[18],选择的最适进化模型为JTT+G[19],每个节点的可信值进行1 000次重复计算。

1.5 基因的组织分布和表达分析

参考文献[16-17]中的方法,采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法检测,荧光定量引物见表2。qRT-PCR反应参数:95 °C预变性30 s;95 °C变性5 s,57 °C退火30 s,72 °C延伸30 s,共40个循环。相对表达水平采用 ${2^{ - \Delta \Delta { C_T}}} $ 方法计算[20]。选用双内参(β-actingapdh)进行标准化。本研究预试验表明,这2个内参组合在黄颡鱼不同组织及不同铜暴露浓度下的表达水平是稳定的。

表 2 黄颡鱼WNT2、WNT2BB、WNT3A、WNT8A和CTNNB1氨基酸序列与其他鱼类同源性分析 Tab.2 Amino acid sequence identity of WNT2, WNT2BB, WNT3A, WNT8A and CTNNB1 between P. fulvidraco and other species %
1.6 数据分析

结果采用平均值±标准误(mean±SE)进行表示。统计分析之前,采用Kolmogorov-Smirnov检验所有数据的正态分布性。不同处理间方差的同质性使用Bartlett检验。实验处理组之间进行单因素方差分析和Duncan氏多重比较检验。显著性水平取0.05。采用SPSS 19.0软件进行数据分析。

2 结果 2.1 wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1序列的分子特征及进化分析

本研究通过RT-PCR和RACE方法获得wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因的cDNA全长序列,长度分别为1 743、2 133、1 379、1 508和2 636 bp (表1)。序列分析显示它们的cDNA序列ORF长度分别为1 052、1 115、872、1 160和2 372 bp,翻译成蛋白所得到的氨基酸数分别为351、372、291、387和791。

多肽序列比对发现黄颡鱼WNT2、WNT2BB、WNT3A、WNT8A和CTNNB1氨基酸序列与其他鱼类和哺乳类的同源性分别为69.7%~85.7%、72.5%~87.6%、71.3%~89.0%、60.4%~74.4%和95.5%~97.4%(表2)。

黄颡鱼和其他脊椎动物wntsctnnb1基因的进化树见图1。在进化树中,硬骨鱼WNT2BB、WNT3A、WNT8A与两栖类聚为一支,哺乳类独立聚为另外一支。其中黄颡鱼WNT2BB和WNT8A与墨西哥丽脂鲤(Astyanax mexicanus)亲缘关系最近;硬骨鱼WNT2独立聚为一支,而两栖类和哺乳类WNT2与WNT2BB聚为另外一支;与其他硬骨鱼类相比,黄颡鱼WNT2与墨西哥丽脂鲤亲缘关系最近(图1-a);哺乳动物CTNNB1单独聚为一支,黄颡鱼CTNNB1与斑马鱼和墨西哥丽脂鲤聚为一支,与其亲缘关系最近(图1-b)。

图 1 基于NJ法构建的脊椎动物WNTs (a)和CTNNB1(b)氨基酸序列的系统发育树 Bootstrap检验的重复次数为1 000次 Fig. 1 NJ phylogenetic tree of amino acid sequences from vertebrate WNTs (a) and CTNNB1 (b) The tree is based on a 1 000 bootstrap procedure
2.2 wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1序列的mRNA组织表达模式

wnt2 mRNA在肌肉中表达最高,其次是鳃和肠脂,而在其他组织中无显著差异(图2-a);wnt2bb mRNA在肌肉中表达最高,其次是肠脂、脾脏、脑、鳃、肝脏,而在其他组织中无显著性差异(图2-b);wnt3a mRNA在肠脂中表达最高,其次是肌肉、鳃、脑,而在其他组织中无显著性差异(图2-c);Wnt8a mRNA在肌肉中表达最高,其次是卵巢,在脑、脾脏、肾脏、鳃、心脏、肠脂、肝脏等组织中无显著性差异(图2-d);ctnnb1 mRNA在脑中表达最高,其次是卵巢,而在脾脏、肾脏、鳃、心脏、肠脂和肝脏中无显著性差异(图2-e)。

图 2 黄颡鱼Wntsctnnb1在不同组织中的表达情况 (a) wnt2, (b) wnt2bb, (c) wnt3a, (d) wnt8a, (e) ctnnb1; 1. 脑,2. 脾,3. 肾,4. 鳃,5. 心脏,6. 肌肉,7. 肠脂,8. 肝脏,9. 卵巢;不同字母表示有显著性差异,下同 Fig. 2 Relative expression of P. fulvidraco wnts and ctnnb1 in different organs and tissues (a) wnt2, (b) wnt2bb, (c) wnt3a, (d) wnt8a, (e) ctnnb1; 1. brain, 2. spleen, 3. kidney, 4. gill, 5. heart, 6. muscle, 7. fat, 8. liver, 9. ovary; different letters indicate significant difference, the same below
2.3 水体铜暴露对黄颡鱼卵巢wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因表达水平的影响

在暴露28 d,wnt3a mRNA水平随着铜浓度的增加而降低,而wnt8a则呈现相反的结果(图3-a)。在暴露56 d,各个基因表达与对照组相比,30 μg/L和60 μg/L铜暴露均无显著差异(图3-b)。

图 3 第28天(a)和第56天(b)铜暴露对黄颡鱼卵巢中wntsctnnb1基因mRNA表达的影响 Fig. 3 Effect of Cu exposure on the mRNA levels of genes in the ovary of P. fulvidraco on day 28(a) and day 56(b) 1. wnt2, 2. wnt2bb, 3. wnt3a, 4. wnt8a, 5. ctnnb1
3 讨论 3.1 wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1序列的分子特征与进化分析

本研究克隆得到了黄颡鱼wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因的cDNA全长序列。分析这些基因的蛋白序列发现,黄颡鱼CTNNB1和其他鱼类及哺乳类有相同的氨基酸残基和剪切位点,4个WNT蛋白具有一些保守的结构域,如具有N-糖基化位点和保守的半胱氨酸残基等[821-22]。研究指出,WNT蛋白富含半胱氨酸,这些半胱氨酸之间形成的二硫键对其正确折叠非常重要。N-糖基化是WNT蛋白的一个重要修饰,它们对WNT的分泌和正常功能的行使至关重要[23]。进化树分析进一步发现黄颡鱼WNT2、WNT2BB、WNT3A、WNT8A和CTNNB1多肽与其他鱼类的亲近性和物种的分类地位相符,与曹梅等[24]在斑点叉尾鮰(Ictalurus punctatus)中的研究结果相似。

3.2 wnt2、wnt2bbwnt3awnt8awtnnb1序列的组织表达模式

研究基因的组织分布模式有助于了解该基因潜在的生理功能。Wnt分子可激发细胞内多种信号途径,参与生物体多种生理与病理学过程,然而,目前在鱼类中有关这些基因mRNA组织表达模式还未见报道。本研究表明,wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因在黄颡鱼各组织中均有表达,但不同组织间的表达水平差异较大,表明Wnt/β-catenin信号通路广泛地参与机体各个组织的生理活动;另一方面不同组织差异性的表达模式可能反映了不同组织特有的生物学作用。相似的,Ricken等[22]指出wnt2和wnt2b在小鼠卵巢中均有表达,表明wnt2和wnt2b在卵巢发育和成熟中起着重要的调控作用。

3.3 水体铜暴露对黄颡鱼卵巢组织wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因表达水平的影响

前言中已提及,本研究的假设之一是铜对黄颡鱼卵巢发育和激素合成的影响与Wnt/β-catenin信号通路有关。然而,无论是陆生(包括哺乳动物)还是水生动物,目前还没有有关铜影响Wnt/β-catenin信号通路这些基因表达水平的报道;而且,目前仅见Wnt通路能通过激活β-catenin提高FSH的作用效果[12],FSH可影响性腺合成和性激素分泌,从而影响卵泡发育、成熟和排卵,所以可以推断铜可直接或间接通过Wnt/β-catenin信号通路来调节卵巢发育和激素合成。本研究表明,在28 d时,wnt3a mRNA水平随着铜浓度的增加而降低,而wnt8a则呈现相反的结果;在56 d,这几个基因的表达水平均无显著性差异。Wnt经典通路(Wnt/β-catenin)是通过β-catenin和其他分子的共同作用来调节细胞增殖、分化等[125-26]。有研究指出,wnt2在未成熟小鼠卵泡发育各个时期的卵巢粒层细胞中均有表达[22],并且在添加FSH培养的牛粒层细胞中wnt2基因表达量上升[27],说明Wnt/β-catenin信号通路参与并调控卵巢组织的生长与发育。本研究初步发现,在低铜诱导下,Wnt/β-catenin信号通路可能参与铜影响的黄颡鱼卵巢发育和激素合成的调节。最近的研究也发现,作为Wnt通路的重要成员,FZD家族部分成员也介导了铜影响黄颡鱼卵巢发育的调控[28]。因此,深入阐明Wnt/β-catenin信号通路在铜影响黄颡鱼卵巢发育和激素合成中的作用机制,有助于揭示铜影响黄颡鱼卵巢发育和激素合成的机理,这将为研究铜的繁殖营养和毒性效应提供新的思路。

本研究获得了黄颡鱼wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因的cDNA全长序列,为深入解析它们的功能奠定了基础;研究发现这些基因在脑、脾脏、肾脏、鳃、心脏、肌肉、脂肪、肝脏及卵巢中都有表达,但表达水平不尽相同,表明它们广泛地参与黄颡鱼体内的生理过程;铜暴露差异性影响了Wnt/β-catenin信号通路wnt2、wnt2bbwnt3awnt8actnnb1基因的mRNA水平,表明它们的基因功能发生了分化,并可能介导了铜影响黄颡鱼卵巢发育的调控。

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Identification of five genes from Wnt/β-catenin pathway inyellow catfish (Pelteobagrus fulvidraco) and their mRNA expression inthe ovary to waterborne copper exposure
ZHANG Lihan, LUO Zhi, YOU Wenjing, LI Dandan, XU Yihuan, PAN Yaxiong     
Key Laboratory of Agricultural Animal Genetics ,Breeding and Reproduction, Ministry of Education, College of Fisheries, Huazhong Agricultural University, Wuhan    430070, China
Abstract: Five complete cDNA sequences related to Wnt/β-catenin signal pathway, designated wnt2, wnt2bb, wnt3a, wnt8a and ctnnb1, were amplified by RT-PCR and RACE approaches from yellow catfish (Pelteobagrus fulvidraco). The validated cDNAs encoding wnt2, wnt2bb, wnt3a, wnt8a and ctnnb1 were 1 743, 2 133, 1 379, 1 508 and 2 636 bp in length, encoding peptides of 351, 372, 291, 387 and 791 amino acid residues, respectively. The amino acid alignment and phylogenetic analysis revealed that these sequences were relatively conserved among vertebrates, and Wnt/β-catenin genes of P. fulvidraco were more closely related to those of Astyanax mexicanus. All Wnt/β-catenin mRNAs were expressed in nine tested tissues (brain, spleen, kidney, gill, heart, muscle, mesenteric fat, liver and ovary), but at variable levels. Effect of waterborne Cu exposure on ovarian mRNA levels of the five genes of P. fulvidraco were determined. On day 28, wnt3a mRNA levels in the ovary significantly decreased with increasing waterborne Cu concentration, but wnt8a showed the opposite trend. On day 56, mRNA levels of these five genes from the ovary of P. fulvidraco showed no significant differences among the three groups. The present study may be helpful to understand the physiological functions of Wnt/β-catenin pathway in fish.
Key words: Pelteobagrus fulvidraco    Wnt/β-catenin    gene cloning    tissue    copper exposure